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经过研究发现人体内大约有100万亿个微生物，这些微生物加起来的重量大约是1.5公斤，相当于一个肝脏的重量。人体的肠道更是一个拥有着亿万共生微生物的家园。在这一个微生态的环境中，包含了病毒真菌，细菌菌群以及一些少量的螺旋体等。其中肠道菌群在肠道的微生态中占有的最重要的地位。肠道菌群一共分为三类，一种是有害菌，一种是有益菌，另外一种是条件致病菌。

消化道一直以来被称为人的第二大脑，主要是由于其中有着非常多的神经组织，被称为第二，大脑也突出地显示了消化道神经组织的重要性。

人体中存在着很多的微生态，比如皮肤的微生态，胃肠道的微生态呼吸的微生态泌尿，或者是生殖道的微生态等，在众多的微生态中，最重要最复杂的也就是肠道微生态。肠道微生态所包含的有肠壁，肠道菌群，肠道分泌物，还有人体吃进去的食物，其中的核心为肠道菌群。

肠道菌群在人体中有着非常重要的作用：

1. 消化功能。肠道中的抑菌，帮助人体消化膳食纤维。

2. 合成维生。肠道菌群可以合成多种人体所需要的各种维生素。

3. 肠-脑轴双向调节。人体内的细菌将膳食纤维消化了之后，就会产生短链脂肪酸，这些短链脂肪酸能够将肠道内的细胞进行修复，同时还可以修复长脑轴，双向调节。长与脑实际上是互通的。患有抑郁症的人，其肠道内有益的细菌数量是偏少，补充有益的细菌，对于缓解抑郁症患者的情绪会有很大的帮助。

4. 代谢调节。肠道菌群能够调节糖类和脂肪类的代谢。

5. 免疫功能。人体最重要的免疫器官之一就是肠道，可以给人提供大部分所需要的营养物质和能量。

6. 屏障的功能。肠道内的有益菌能够有效的对抗肠道内潜在的病菌，抑制一些外源性致病菌的繁殖能力。

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